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柠檬书坊 -天文学 -基因组信息学实践教程9787567238664兴海图书专营店

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基因组信息学实践教程9787567238664兴海图书专营店书籍详细信息

  • ISBN：9787567238664
  • 作者：暂无作者
  • 出版社：暂无出版社
  • 出版时间：2022-09
  • 页数：暂无页数
  • 价格：66.00
  • 纸张：胶版纸
  • 装帧：平装-胶订
  • 开本：16开
  • 语言：未知
  • 丛书：暂无丛书
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内容简介：

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书籍目录：

绪论/1篇 基础实践/9

项目1基因组测序模拟/9

项目2序列组装/16

项目3基因组注释之同源基因搜索/26

项目4基因组注释之从头预测与基因结构建模/37

项目5基因组注释之DNA元件预测/45

项目6基因组数据可视化/59

篇扩展实践/64

项目1高通量测序平台及模拟工具的对比/64

项目2基因组序列组装软件的对比/67

项目3 RNA-Seq数据从头组装软件的对比/70

项目4从头计算预测基因软件的比较/73

项目5基于转录组数据的新基因和转录变异体的发现/76

项目6基因转录调控分析/79

项目7基因组测序可视化工具的对比/87

第三篇 综合实践/90

项目1基因组测序模拟的编程实现/90

项目2同源基因搜索指导的基因结构预测 /94

项目3基于RNA-Seq数据的基因组注释/100

项目4 基于多重数据源的基因结构特征训练和应用 / 107

项目5基因结构特征模型参数的编程实践/110

项目6多重证据联合的基因结构建模/114

项目7转录因子调控机制分析/117

其他综合实践设想/123

第四篇常用软件使用手册/124

1. ART / 124

2. Augustus / 136

3. BamTools / 152

4. BCFtools / 156

5. bedtools / 191

6. Bowtie2 / 213

7. FastQC / 235

8.GFF格式处理工具/249

9. NCBI BLAST / 260

10. NCBI SRA Toolkit / 276

11. QUAST / 286

12. Samtools / 298

13. SOAPdenovo / 325

14. Trimmomatic / 339

15. Trinity / 343

16.文件格式转换工具/353

附录/354

附录1基因组坐标体系/354

附录2常用数据格式/357

参考文献 /383

作者介绍：

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出版社信息：

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  • 思想传递：9分

  • 知识深度：6分

  • 知识广度：4分

  • 实用性：9分

  • 章节划分：6分

  • 结构布局：5分

  • 新颖与独特：6分

  • 情感共鸣：5分

  • 引人入胜：8分

  • 现实相关：7分

  • 沉浸感：4分

  • 事实准确性：4分

  • 文化贡献：7分

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